Susunan organisasi Dinas Kesehatan Provinsi Jawa Tengah adalah sebagai berikut :

a. Kepala Dinas;
b. Sekretariat;
c. Bidang Kesehatan Masyarakat ;
d. Bidang Pencegahan dan Pengendalian Penyakit;
e. Bidang Pelayanan Kesehatan;
f. Bidang Sumber Daya Kesehatan;
g. UPT Dinas; dan
h. Kelompok Jabatan Fungsional

Struktur Organisasi Dinas Kesehatan Provinsi Jawa Tengah adalah sbb: